Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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