Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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