Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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