Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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RPE65Q16518 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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