Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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