Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NTRK3Q16288 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NTRK3Q16288 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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