Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAMP3Q15836 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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