Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SIX1Q15475 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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