Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23BQ15437 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23BQ15437 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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