Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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