Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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