Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL19A1Q14993 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL19A1Q14993 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL19A1Q14993 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL19A1Q14993 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL19A1Q14993 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL19A1Q14993 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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COL19A1Q14993 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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COL19A1Q14993 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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COL19A1Q14993 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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COL19A1Q14993 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL19A1Q14993 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL19A1Q14993 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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