Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCINQ13939 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCINQ13939 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CCINQ13939 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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CCINQ13939 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCINQ13939 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCINQ13939 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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