Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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