Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR1Q13613 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms