Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KRR1Q13601 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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