Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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C1orf61Q13536 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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C1orf61Q13536 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C1orf61Q13536 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
C1orf61Q13536 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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