Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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