Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms