Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRDMT1O14717 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRDMT1O14717 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRDMT1O14717 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRDMT1O14717 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
TRDMT1O14717 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDMT1O14717 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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