Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
J3KRW8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
J3KRW8 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
J3KRW8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
J3KRW8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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