Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
USP18Q9UMW8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USP18Q9UMW8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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