Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GLIS1Q8NBF1 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GLIS1Q8NBF1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms