Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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PTPRNQ16849 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PTPRNQ16849 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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PTPRNQ16849 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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PTPRNQ16849 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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