Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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