Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ME3Q16798 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ME3Q16798 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ME3Q16798 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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