Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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