Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPE65Q16518 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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