Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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