Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNHIT3Q15649 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms