Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHHQ15465 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHHQ15465 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHHQ15465 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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