| CLCA4 | Q14CN2 | MIR1252-201 | ENST00000408861 | 65 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC112220.1-201 | ENST00000434628 | 355 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC010469.2-201 | ENST00000496412 | 480 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MRPS35P2-201 | ENST00000508242 | 191 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR449C-201 | ENST00000516047 | 92 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-635P-201 | ENST00000516651 | 102 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | LINC01206-214 | ENST00000610910 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | ZNRD1-AS1_2.5-201 | ENST00000614729 | 76 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL590808.1-201 | ENST00000618696 | 141 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR7843-201 | ENST00000622274 | 79 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | OXR1-215 | ENST00000531443 | 3599 nt | TSL 5 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AGTPBP1-205 | ENST00000376083 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-238P-201 | ENST00000363313 | 106 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | Y_RNA.152-201 | ENST00000363578 | 100 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-281P-201 | ENST00000384212 | 103 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR9-1-201 | ENST00000385198 | 89 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SNORD78.2-201 | ENST00000391076 | 69 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC121342.1-201 | ENST00000423914 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | Z68323.1-201 | ENST00000450365 | 519 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC007215.1-201 | ENST00000464893 | 276 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | KRTAP13-6P-201 | ENST00000508999 | 371 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SNORA31.15-201 | ENST00000516771 | 132 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC109329.2-201 | ENST00000519658 | 482 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CLCA4 | Q14CN2 | AL355297.3-201 | ENST00000604082 | 446 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC010999.1-201 | ENST00000611856 | 324 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC005562.2-201 | ENST00000618264 | 111 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR5739-201 | ENST00000619803 | 80 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC080100.1-201 | ENST00000624239 | 5356 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | BX322639.1-202 | ENST00000423987 | 2213 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RGS18-201 | ENST00000367460 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | CHD9-202 | ENST00000398510 | 11337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | Y_RNA.551-201 | ENST00000384661 | 102 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-1105P-201 | ENST00000384774 | 107 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-220P-201 | ENST00000390919 | 107 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNA5SP213-201 | ENST00000391031 | 106 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SNORD12B-201 | ENST00000410433 | 91 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AJ239322.2-201 | ENST00000421696 | 575 nt | TSL 5 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MTND3P2-201 | ENST00000438452 | 342 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC004386.2-201 | ENST00000441858 | 148 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC010655.3-201 | ENST00000478818 | 450 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC034114.1-201 | ENST00000520293 | 285 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC026470.2-201 | ENST00000561492 | 181 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | PTP4A1-204 | ENST00000578299 | 135 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR3605-201 | ENST00000583214 | 100 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL356575.1-201 | ENST00000603008 | 283 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RAC1P9-201 | ENST00000604990 | 392 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC008121.3-201 | ENST00000618726 | 433 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | ANKRD18EP-201 | ENST00000405487 | 2632 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC135776.4-201 | ENST00000624300 | 1904 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | TBC1D31-206 | ENST00000518805 | 2201 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RPAP3-202 | ENST00000380650 | 2149 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | OR2J3-203 | ENST00000641960 | 3342 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-859P-201 | ENST00000362728 | 107 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU5F-3P-201 | ENST00000363767 | 117 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | Y_RNA.179-201 | ENST00000363844 | 90 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL358176.2-201 | ENST00000425769 | 204 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SDAD1P3-201 | ENST00000427380 | 333 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RPEP5-201 | ENST00000441137 | 268 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU7-26P-201 | ENST00000458980 | 63 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | UBL5P3-201 | ENST00000475112 | 231 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SNORA40.15-201 | ENST00000516884 | 107 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | DEFB131C-201 | ENST00000528817 | 165 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC004486.1-201 | ENST00000546846 | 233 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL117187.1-201 | ENST00000555482 | 181 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC084882.1-201 | ENST00000561254 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC023824.2-201 | ENST00000566185 | 400 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC022809.1-201 | ENST00000579247 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR4659A-201 | ENST00000580269 | 81 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR3670-1-201 | ENST00000584160 | 65 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR3670-3-201 | ENST00000584855 | 65 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL355512.1-202 | ENST00000607952 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | ZNRD1-AS1_3.8-201 | ENST00000611686 | 104 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | ST7-OT4_1.1-201 | ENST00000615322 | 200 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | UHMK1-204 | ENST00000545294 | 8117 nt | TSL 2 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | CLLU1-201 | ENST00000378485 | 3897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | TAB3-205 | ENST00000378933 | 6671 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SNORA38-201 | ENST00000363946 | 132 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | SNORA63.7-201 | ENST00000365579 | 123 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-245P-201 | ENST00000384020 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU6-793P-201 | ENST00000384233 | 104 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR592-201 | ENST00000384959 | 97 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AL033519.2-201 | ENST00000403958 | 392 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | BCL2L11-207 | ENST00000405953 | 425 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MIR1294-201 | ENST00000408503 | 142 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | Y_RNA.595-201 | ENST00000410403 | 105 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNU2-63P-201 | ENST00000410792 | 194 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | MRLN-201 | ENST00000414264 | 422 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC080013.2-201 | ENST00000460866 | 323 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC108516.1-201 | ENST00000503666 | 257 nt | TSL 2 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CLCA4 | Q14CN2 | RNY3P15-201 | ENST00000516297 | 97 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |