Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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SHPRHQ149N8 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
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SHPRHQ149N8 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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