Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE1CQ14123 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms