Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A3Q14050 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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