Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PKP1Q13835 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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