Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBA3CQ13748 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms