Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TOP3AQ13472 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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