Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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TMED1Q13445 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TMED1Q13445 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TMED1Q13445 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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TMED1Q13445 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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TMED1Q13445 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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TMED1Q13445 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMED1Q13445 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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