Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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