Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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