Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HSPB3Q12988 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HSPB3Q12988 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms