Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXO1Q12778 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXO1Q12778 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms