Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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HOXD11P31277 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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