Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYF2O95926 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYF2O95926 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYF2O95926 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYF2O95926 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYF2O95926 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYF2O95926 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYF2O95926 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYF2O95926 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYF2O95926 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms