Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNX13Q9Y5W8 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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