Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CIPCQ9C0C6 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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