Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
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