Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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