Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPN21Q16825 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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